商标侵权未判决撤诉后，工商部门能否继续调查？
我不能。
只要原厂商商标所有人撤诉，双方协商后工商部门不会处罚，厂商不追究工商部门也不会管。
《商标法》第六十条有本法第五十七条所列行为之一，侵犯注册商标专用权，引起争议的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院提起诉讼或者请求工商行政管理部门处理。
只要原厂商商标所有人撤诉，双方协商后工商部门不会处罚，厂商不追究工商部门也不会管。
《商标法》第六十条有本法第五十七条所列行为之一，侵犯注册商标专用权，引起争议的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院提起诉讼或者请求工商行政管理部门处理。