在商标上标注新疆长绒棉是否违反商标法？

根据《商标法》第16条规定，“商标含有商品地理标志，且该商品非源于该标志所标示的区域的，不予注册，禁止使用。”“新疆长绒棉”名义的商标无法通过商标局的注册审查。

如果商标不能注册，说明商标不符合要求，需要修改后再重新提交申请。常见的原因可能是有相似的商标或者提交的申请材料不完整才被驳回。