为什么不同氨基酸之间的差异是由R基团而不是dna或mrna决定的？它们不决定氨基酸的种类吗？

这个问题问的是不同氨基酸的性质，而不是蛋白质中每个氨基酸的种类和排列顺序。

单独把一个氨基酸拿出来，它只是一个化合物，和蛋白质没有关系。对于化合物来说，不同种类的氨基酸，就像碳酸钠和碳酸钾一样，只看其结构与化学性质的关系。显然，影响不同种类氨基酸的化学和物理性质的因素只有R基团，如溶解度、酸碱性、等电点等。即使从它们的分子结构来看，不同种类的氨基酸也只是它们的R基团不同。由于R基团不同，它们之间的物理化学性质也不同。如下图。

对于某种蛋白质来说，氨基酸的种类和排列顺序是由基因决定的。这是对的。体现在蛋白质上，就是蛋白质结构和功能的不同。

如果问氨基酸，只需要考虑氨基酸，不用考虑蛋白质。