请问方正大黑简化应用在网站有版权吗?

看情况吧。

不是侵权:只是网站上有些字用的是方正字体。

侵权:如果你的数据库使用方正字体,而这个字体是盗版的,那就是侵权。

总的原则是单个字不享有版权,多个字甚至几个字的使用都不侵权,只要字体不是整体使用就不侵权。